L’AGEREF/CL est constituée de l’ensemble des Associations Villageoises de Gestion des Terroirs et des Ressources Naturelles (AGTREN) des 17 villages riverains de la FCRPF/CL. Elle est administrée par les instances suivantes :

 Une (1) Assemblée Générale qui compte 102 membres à raison de 6 représentants par village. Elle est l’organe suprême et, à cet effet, approuve les programmes d’activités et budgets de l’Association ;
 Un (1) Bureau composé de 17 membres soit un (1) membre par village,
 Un (1) Secrétariat Exécutif qui constitue le personnel technique chargé d’appuyer l’AGEREF/CL dans la mise en œuvre du Plan d’Aménagement et de Gestion de sa concession.